落實本校海洋特色定位，將海洋研究之發展聚焦於「水產產業創新」、「海洋綠能與環境」、「海洋管理與人文」及「海洋工程與機電」四大主軸，結合本校海洋科技及其他跨領域專業,進行優勢互補及技術融合，共同發展合作策略、強化與產業的鏈結，透過學術研究的潛能以及與產業密切的關係，加速海洋產業技術的提升，帶動更大的產業價值與社會效益。
- 海洋綠能與環境：海洋能源、離岸風電、海洋環境、海洋資源再利用
- 水產產業創新：永續漁業、智慧養殖、水產加值應用、海洋生技
- 海洋管理與人文：航運港埠經營、海洋供應鏈產業、海洋保育、海岸創生、海洋文教、海洋法政、海事資訊
- 海洋工程與機電：海洋機械、海洋土木、海洋機電。
